Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmo2P25801 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo2P25801 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmo2P25801 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmo2P25801 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms