Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou2f1P25425 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou2f1P25425 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou2f1P25425 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms