Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pax3P24610 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pax3P24610 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pax3P24610 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pax3P24610 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pax3P24610 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pax3P24610 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pax3P24610 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pax3P24610 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pax3P24610 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pax3P24610 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pax3P24610 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pax3P24610 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pax3P24610 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pax3P24610 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms