Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Aldh1a1P24549 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aldh1a1P24549 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a1P24549 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aldh1a1P24549 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a1P24549 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms