Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd12P23812 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd12P23812 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxd12P23812 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 772.8 ms