Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PparaP23204 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PparaP23204 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PparaP23204 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PparaP23204 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PparaP23204 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PparaP23204 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PparaP23204 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PparaP23204 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PparaP23204 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PparaP23204 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PparaP23204 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PparaP23204 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PparaP23204 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PparaP23204 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PparaP23204 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PparaP23204 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PparaP23204 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PparaP23204 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PparaP23204 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PparaP23204 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PparaP23204 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PparaP23204 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PparaP23204 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PparaP23204 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PparaP23204 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PparaP23204 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PparaP23204 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PparaP23204 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PparaP23204 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PparaP23204 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PparaP23204 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PparaP23204 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PparaP23204 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PparaP23204 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PparaP23204 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PparaP23204 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PparaP23204 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PparaP23204 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PparaP23204 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PparaP23204 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PparaP23204 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PparaP23204 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PparaP23204 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PparaP23204 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PparaP23204 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PparaP23204 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PparaP23204 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PparaP23204 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PparaP23204 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PparaP23204 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PparaP23204 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PparaP23204 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PparaP23204 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PparaP23204 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PparaP23204 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PparaP23204 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PparaP23204 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PparaP23204 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PparaP23204 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PparaP23204 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PparaP23204 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PparaP23204 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PparaP23204 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PparaP23204 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PparaP23204 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PparaP23204 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PparaP23204 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PparaP23204 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PparaP23204 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PparaP23204 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PparaP23204 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PparaP23204 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PparaP23204 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PparaP23204 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PparaP23204 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PparaP23204 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PparaP23204 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PparaP23204 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PparaP23204 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PparaP23204 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PparaP23204 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PparaP23204 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PparaP23204 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PparaP23204 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PparaP23204 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PparaP23204 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PparaP23204 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PparaP23204 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PparaP23204 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PparaP23204 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PparaP23204 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PparaP23204 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PparaP23204 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms