Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk1P22518 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk1P22518 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk1P22518 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clk1P22518 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk1P22518 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk1P22518 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clk1P22518 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk1P22518 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk1P22518 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk1P22518 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clk1P22518 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk1P22518 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk1P22518 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk1P22518 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk1P22518 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk1P22518 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk1P22518 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk1P22518 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk1P22518 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk1P22518 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clk1P22518 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clk1P22518 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clk1P22518 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clk1P22518 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clk1P22518 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clk1P22518 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms