Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F3P20352 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F3P20352 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F3P20352 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F3P20352 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F3P20352 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F3P20352 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F3P20352 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F3P20352 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F3P20352 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F3P20352 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F3P20352 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
F3P20352 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
F3P20352 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F3P20352 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F3P20352 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F3P20352 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
F3P20352 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F3P20352 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F3P20352 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F3P20352 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F3P20352 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F3P20352 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F3P20352 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F3P20352 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F3P20352 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F3P20352 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F3P20352 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F3P20352 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F3P20352 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
F3P20352 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
F3P20352 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F3P20352 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F3P20352 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F3P20352 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
F3P20352 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F3P20352 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F3P20352 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F3P20352 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F3P20352 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F3P20352 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F3P20352 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F3P20352 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F3P20352 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F3P20352 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F3P20352 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F3P20352 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F3P20352 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F3P20352 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F3P20352 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F3P20352 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F3P20352 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F3P20352 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F3P20352 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F3P20352 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F3P20352 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
F3P20352 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F3P20352 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F3P20352 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F3P20352 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F3P20352 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F3P20352 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F3P20352 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
F3P20352 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F3P20352 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F3P20352 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
F3P20352 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F3P20352 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F3P20352 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F3P20352 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F3P20352 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F3P20352 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F3P20352 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F3P20352 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
F3P20352 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F3P20352 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F3P20352 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F3P20352 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F3P20352 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F3P20352 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F3P20352 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F3P20352 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F3P20352 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F3P20352 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F3P20352 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F3P20352 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
F3P20352 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F3P20352 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F3P20352 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F3P20352 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F3P20352 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F3P20352 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F3P20352 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F3P20352 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms