Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdc1P18828 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sdc1P18828 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc1P18828 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdc1P18828 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms