Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
P18533 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P18533 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P18533 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P18533 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P18533 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P18533 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P18533 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P18533 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P18533 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P18533 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P18533 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P18533 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P18533 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P18533 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P18533 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P18533 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P18533 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P18533 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18533 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18533 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18533 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18533 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18533 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18533 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P18533 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P18533 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P18533 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18533 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18533 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18533 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18533 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18533 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18533 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18533 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P18533 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18533 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18533 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P18533 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P18533 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P18533 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P18533 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P18533 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18533 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18533 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18533 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18533 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18533 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18533 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P18533 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18533 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P18533 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P18533 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P18533 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P18533 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P18533 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P18533 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P18533 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P18533 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P18533 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P18533 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P18533 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P18533 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P18533 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P18533 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P18533 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P18533 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P18533 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P18533 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P18533 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P18533 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P18533 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P18533 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P18533 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P18533 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P18533 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
P18533 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P18533 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P18533 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P18533 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P18533 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P18533 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P18533 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P18533 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P18533 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P18533 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P18533 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P18533 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P18533 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P18533 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P18533 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P18533 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P18533 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P18533 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms