Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs1P17533 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa-rs1P17533 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Defa-rs1P17533 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa-rs1P17533 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs1P17533 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa-rs1P17533 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms