Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga5P11688 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga5P11688 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga5P11688 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga5P11688 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga5P11688 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga5P11688 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga5P11688 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga5P11688 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga5P11688 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga5P11688 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga5P11688 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga5P11688 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga5P11688 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga5P11688 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms