Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd8bP10300 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd8bP10300 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd8bP10300 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd8bP10300 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd8bP10300 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd8bP10300 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd8bP10300 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms