Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa1P09022 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa1P09022 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa1P09022 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms