Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prp2P05143 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prp2P05143 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prp2P05143 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prp2P05143 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prp2P05143 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prp2P05143 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prp2P05143 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prp2P05143 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prp2P05143 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prp2P05143 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prp2P05143 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prp2P05143 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prp2P05143 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms