Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk1P04184 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tk1P04184 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tk1P04184 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tk1P04184 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tk1P04184 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tk1P04184 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tk1P04184 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tk1P04184 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tk1P04184 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tk1P04184 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk1P04184 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk1P04184 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk1P04184 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk1P04184 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms