Protein–RNA interactions for Protein: P03893

Mtnd2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd2P03893 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtnd2P03893 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mtnd2P03893 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd2P03893 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd2P03893 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd2P03893 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms