Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Hoxa7P02830 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Hoxa7P02830 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Hoxa7P02830 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Hoxa7P02830 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Hoxa7P02830 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Hoxa7P02830 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Hoxa7P02830 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hoxa7P02830 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Hoxa7P02830 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Hoxa7P02830 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Hoxa7P02830 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Hoxa7P02830 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms