Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
P01915 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01915 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01915 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01915 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01915 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01915 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01915 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01915 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01915 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01915 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01915 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01915 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01915 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01915 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01915 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01915 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01915 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01915 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01915 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01915 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01915 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01915 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01915 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01915 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01915 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01915 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01915 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01915 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01915 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01915 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01915 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01915 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01915 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01915 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01915 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01915 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01915 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01915 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01915 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01915 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01915 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01915 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01915 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01915 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01915 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01915 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01915 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01915 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01915 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01915 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01915 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01915 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01915 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01915 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01915 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01915 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01915 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01915 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01915 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01915 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01915 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01915 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01915 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01915 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01915 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01915 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01915 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01915 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01915 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms