Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01809 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01809 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01809 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01809 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01809 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01809 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01809 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01809 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01809 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01809 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01809 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01809 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01809 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01809 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01809 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01809 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01809 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01809 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01809 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01809 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01809 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01809 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01809 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01809 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01809 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01809 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01809 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01809 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01809 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01809 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01809 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01809 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01809 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01809 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01809 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01809 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01809 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01809 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01809 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01809 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01809 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01809 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01809 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01809 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01809 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01809 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01809 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01809 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01809 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01809 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01809 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01809 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01809 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01809 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01809 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01809 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01809 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01809 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01809 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01809 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01809 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01809 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01809 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01809 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01809 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01809 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01809 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01809 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01809 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01809 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01809 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01809 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01809 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01809 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01809 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01809 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01809 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01809 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01809 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01809 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01809 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01809 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01809 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01809 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01809 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01809 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01809 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01809 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01809 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms