Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01793 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01793 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01793 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01793 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01793 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01793 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01793 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01793 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01793 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01793 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01793 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01793 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01793 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01793 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01793 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01793 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01793 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01793 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01793 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01793 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01793 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01793 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01793 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01793 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01793 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01793 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01793 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01793 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01793 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01793 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01793 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01793 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01793 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01793 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01793 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01793 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01793 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01793 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01793 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01793 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01793 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01793 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01793 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01793 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01793 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01793 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01793 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01793 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01793 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01793 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01793 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01793 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01793 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01793 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01793 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01793 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01793 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01793 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01793 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01793 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01793 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01793 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01793 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01793 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01793 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01793 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms