Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnb1P01575 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnb1P01575 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnb1P01575 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnb1P01575 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifnb1P01575 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnb1P01575 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnb1P01575 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnb1P01575 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnb1P01575 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnb1P01575 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms