Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx8O88983 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx8O88983 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx8O88983 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx8O88983 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stx8O88983 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx8O88983 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx8O88983 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx8O88983 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx8O88983 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx8O88983 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx8O88983 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx8O88983 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx8O88983 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx8O88983 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx8O88983 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx8O88983 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx8O88983 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx8O88983 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx8O88983 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx8O88983 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms