Protein–RNA interactions for Protein: O88533

Ddc, Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdcO88533 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdcO88533 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DdcO88533 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DdcO88533 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DdcO88533 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DdcO88533 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DdcO88533 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdcO88533 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdcO88533 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DdcO88533 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DdcO88533 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdcO88533 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdcO88533 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdcO88533 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdcO88533 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdcO88533 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdcO88533 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdcO88533 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdcO88533 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdcO88533 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DdcO88533 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DdcO88533 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DdcO88533 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DdcO88533 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdcO88533 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdcO88533 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DdcO88533 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DdcO88533 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DdcO88533 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdcO88533 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdcO88533 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdcO88533 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdcO88533 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdcO88533 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdcO88533 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdcO88533 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdcO88533 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdcO88533 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdcO88533 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DdcO88533 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DdcO88533 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DdcO88533 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DdcO88533 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DdcO88533 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DdcO88533 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdcO88533 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdcO88533 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdcO88533 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DdcO88533 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DdcO88533 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DdcO88533 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DdcO88533 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DdcO88533 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DdcO88533 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DdcO88533 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DdcO88533 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DdcO88533 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DdcO88533 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DdcO88533 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DdcO88533 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DdcO88533 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DdcO88533 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DdcO88533 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DdcO88533 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DdcO88533 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DdcO88533 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DdcO88533 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DdcO88533 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DdcO88533 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DdcO88533 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DdcO88533 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DdcO88533 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DdcO88533 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DdcO88533 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DdcO88533 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DdcO88533 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DdcO88533 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DdcO88533 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DdcO88533 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DdcO88533 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DdcO88533 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DdcO88533 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DdcO88533 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DdcO88533 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DdcO88533 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DdcO88533 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DdcO88533 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DdcO88533 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DdcO88533 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DdcO88533 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DdcO88533 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DdcO88533 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DdcO88533 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms