Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkcO88445 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AurkcO88445 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AurkcO88445 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkcO88445 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkcO88445 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkcO88445 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkcO88445 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AurkcO88445 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AurkcO88445 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms