Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smpd2O70572 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd2O70572 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smpd2O70572 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd2O70572 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms