Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmx1O70218 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmx1O70218 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmx1O70218 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hmx1O70218 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms