Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sigmar1O55242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sigmar1O55242 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sigmar1O55242 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sigmar1O55242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms