Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb5O55234 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb5O55234 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb5O55234 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmb5O55234 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb5O55234 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb5O55234 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb5O55234 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb5O55234 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb5O55234 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms