Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkbO55229 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkbO55229 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkbO55229 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ChkbO55229 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkbO55229 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkbO55229 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ChkbO55229 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChkbO55229 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ChkbO55229 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChkbO55229 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChkbO55229 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChkbO55229 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkbO55229 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkbO55229 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms