Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nck2O55033 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nck2O55033 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nck2O55033 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Nck2O55033 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nck2O55033 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nck2O55033 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nck2O55033 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nck2O55033 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nck2O55033 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nck2O55033 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nck2O55033 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nck2O55033 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms