Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Copb2O55029 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Copb2O55029 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Copb2O55029 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Copb2O55029 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Copb2O55029 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Copb2O55029 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Copb2O55029 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb2O55029 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb2O55029 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb2O55029 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb2O55029 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copb2O55029 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copb2O55029 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb2O55029 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Copb2O55029 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Copb2O55029 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms