Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc3O55013 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3O55013 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3O55013 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc3O55013 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms