Protein–RNA interactions for Protein: O54943

Per2, Period circadian protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per2O54943 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Per2O54943 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Per2O54943 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Per2O54943 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Per2O54943 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Per2O54943 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Per2O54943 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Per2O54943 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Per2O54943 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Per2O54943 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Per2O54943 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Per2O54943 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Per2O54943 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per2O54943 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per2O54943 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per2O54943 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per2O54943 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per2O54943 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per2O54943 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per2O54943 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per2O54943 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per2O54943 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Per2O54943 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Per2O54943 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per2O54943 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per2O54943 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per2O54943 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per2O54943 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per2O54943 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per2O54943 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per2O54943 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per2O54943 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per2O54943 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per2O54943 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per2O54943 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per2O54943 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per2O54943 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per2O54943 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per2O54943 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per2O54943 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per2O54943 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per2O54943 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per2O54943 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per2O54943 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per2O54943 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per2O54943 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per2O54943 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Per2O54943 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per2O54943 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per2O54943 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per2O54943 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per2O54943 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Per2O54943 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per2O54943 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per2O54943 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per2O54943 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per2O54943 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per2O54943 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Per2O54943 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per2O54943 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per2O54943 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per2O54943 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per2O54943 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Per2O54943 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per2O54943 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Per2O54943 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Per2O54943 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Per2O54943 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Per2O54943 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Per2O54943 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Per2O54943 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per2O54943 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per2O54943 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Per2O54943 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Per2O54943 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Per2O54943 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per2O54943 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per2O54943 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per2O54943 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per2O54943 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Per2O54943 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Per2O54943 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per2O54943 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per2O54943 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per2O54943 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per2O54943 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per2O54943 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per2O54943 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Per2O54943 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Per2O54943 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per2O54943 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per2O54943 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per2O54943 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per2O54943 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per2O54943 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per2O54943 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per2O54943 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per2O54943 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per2O54943 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per2O54943 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms