Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk2a2O54833 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a2O54833 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csnk2a2O54833 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk2a2O54833 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms