Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FxnO35943 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FxnO35943 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FxnO35943 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FxnO35943 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FxnO35943 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FxnO35943 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FxnO35943 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FxnO35943 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FxnO35943 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FxnO35943 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FxnO35943 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FxnO35943 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FxnO35943 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FxnO35943 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FxnO35943 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FxnO35943 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FxnO35943 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FxnO35943 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FxnO35943 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FxnO35943 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FxnO35943 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FxnO35943 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FxnO35943 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FxnO35943 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FxnO35943 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FxnO35943 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FxnO35943 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FxnO35943 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FxnO35943 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FxnO35943 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FxnO35943 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FxnO35943 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FxnO35943 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FxnO35943 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FxnO35943 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FxnO35943 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FxnO35943 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FxnO35943 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FxnO35943 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FxnO35943 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FxnO35943 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FxnO35943 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FxnO35943 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FxnO35943 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FxnO35943 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FxnO35943 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FxnO35943 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FxnO35943 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FxnO35943 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FxnO35943 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FxnO35943 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FxnO35943 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FxnO35943 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FxnO35943 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FxnO35943 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FxnO35943 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FxnO35943 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FxnO35943 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FxnO35943 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FxnO35943 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FxnO35943 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FxnO35943 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FxnO35943 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FxnO35943 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FxnO35943 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FxnO35943 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FxnO35943 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FxnO35943 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FxnO35943 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FxnO35943 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FxnO35943 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FxnO35943 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FxnO35943 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FxnO35943 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FxnO35943 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FxnO35943 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FxnO35943 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FxnO35943 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FxnO35943 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FxnO35943 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FxnO35943 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FxnO35943 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FxnO35943 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FxnO35943 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FxnO35943 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FxnO35943 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FxnO35943 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FxnO35943 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FxnO35943 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FxnO35943 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FxnO35943 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FxnO35943 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 898.2 ms