Protein–RNA interactions for Protein: O35723

Dnajb3, DnaJ homolog subfamily B member 3, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb3O35723 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajb3O35723 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajb3O35723 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajb3O35723 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajb3O35723 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajb3O35723 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajb3O35723 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb3O35723 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb3O35723 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnajb3O35723 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms