Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lhx8O35652 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx8O35652 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx8O35652 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms