Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn6O35646 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn6O35646 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn6O35646 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn6O35646 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn6O35646 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn6O35646 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Capn6O35646 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn6O35646 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn6O35646 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn6O35646 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn6O35646 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn6O35646 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn6O35646 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn6O35646 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capn6O35646 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn6O35646 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms