Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Stag2O35638 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stag2O35638 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag2O35638 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stag2O35638 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag2O35638 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stag2O35638 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag2O35638 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag2O35638 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag2O35638 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag2O35638 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag2O35638 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stag2O35638 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stag2O35638 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stag2O35638 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag2O35638 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag2O35638 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms