Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1O35604 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npc1O35604 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npc1O35604 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npc1O35604 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npc1O35604 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npc1O35604 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npc1O35604 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npc1O35604 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npc1O35604 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npc1O35604 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npc1O35604 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npc1O35604 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npc1O35604 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npc1O35604 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1O35604 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms