Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Opn1mwO35599 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Opn1mwO35599 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Opn1mwO35599 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Opn1mwO35599 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1mwO35599 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opn1mwO35599 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Opn1mwO35599 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Opn1mwO35599 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Opn1mwO35599 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Opn1mwO35599 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Opn1mwO35599 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms