Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xbp1O35426 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xbp1O35426 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xbp1O35426 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xbp1O35426 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms