Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2-M9O19442 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M9O19442 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M9O19442 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-M9O19442 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms