Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MttpO08601 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MttpO08601 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MttpO08601 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MttpO08601 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MttpO08601 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MttpO08601 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MttpO08601 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MttpO08601 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MttpO08601 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MttpO08601 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MttpO08601 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MttpO08601 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MttpO08601 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MttpO08601 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MttpO08601 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MttpO08601 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MttpO08601 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MttpO08601 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MttpO08601 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MttpO08601 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MttpO08601 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MttpO08601 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MttpO08601 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MttpO08601 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MttpO08601 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MttpO08601 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MttpO08601 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MttpO08601 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MttpO08601 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MttpO08601 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MttpO08601 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MttpO08601 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MttpO08601 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MttpO08601 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MttpO08601 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MttpO08601 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MttpO08601 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MttpO08601 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MttpO08601 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MttpO08601 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MttpO08601 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MttpO08601 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MttpO08601 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MttpO08601 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MttpO08601 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MttpO08601 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MttpO08601 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MttpO08601 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MttpO08601 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MttpO08601 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MttpO08601 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MttpO08601 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MttpO08601 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MttpO08601 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MttpO08601 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MttpO08601 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MttpO08601 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MttpO08601 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MttpO08601 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MttpO08601 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MttpO08601 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MttpO08601 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MttpO08601 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MttpO08601 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MttpO08601 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MttpO08601 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MttpO08601 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MttpO08601 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MttpO08601 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MttpO08601 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MttpO08601 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MttpO08601 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MttpO08601 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MttpO08601 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MttpO08601 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MttpO08601 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MttpO08601 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MttpO08601 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MttpO08601 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MttpO08601 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MttpO08601 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MttpO08601 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MttpO08601 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MttpO08601 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MttpO08601 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms