Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf6O08584 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf6O08584 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf6O08584 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf6O08584 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf6O08584 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf6O08584 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf6O08584 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klf6O08584 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf6O08584 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf6O08584 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf6O08584 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf6O08584 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf6O08584 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf6O08584 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf6O08584 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf6O08584 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf6O08584 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf6O08584 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf6O08584 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf6O08584 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms