Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d1O08532 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d1O08532 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d1O08532 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d1O08532 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d1O08532 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms