Protein–RNA interactions for Protein: L7MTX3

1700020N15Rik, RIKEN cDNA 1700020N15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020N15RikL7MTX3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700020N15RikL7MTX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700020N15RikL7MTX3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700020N15RikL7MTX3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700020N15RikL7MTX3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms