Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3248K7N721 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3248K7N721 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3248K7N721 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3248K7N721 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3248K7N721 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3248K7N721 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3248K7N721 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3248K7N721 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3248K7N721 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3248K7N721 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms