Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm4791J3QQ14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm4791J3QQ14 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4791J3QQ14 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms